Zoals elke innovatie kunnen ook parkeerbeheersystemen nadelen hebben. Het meest voor de hand liggend is dat de prijs de grootste zorg is voor veel werkgevers. Sommige parkeerbeheersystemen kunnen veel geld kosten en werkgevers weten vaak niet zeker hoe ze dit geld zullen terugverdienen. Het rendement van dit soort oplossingen zit hem echter in de mogelijkheid om de bezettingsgraad te meten. Op basis van deze gegevens kunnen werkgevers datagestuurde beslissingen nemen.
Een andere zorg van veel werkgevers zijn systeemstoringen. Zoals bij elke technologische oplossing is het onvermijdelijk dat het systeem op een bepaald moment defect raakt. Dit kan echter grotendeels worden voorkomen door regelmatig onderhoudsafspraken te maken.
Dit brengt ons bij de laatste zorg van veel werkgevers: De hoeveelheid onderhoud die zo'n systeem met zich meebrengt. Het kost niet alleen geld om iemand het systeem te laten controleren, het kost ook tijd om deze onderhoudsbezoeken in te plannen. Hoewel deze afspraken veel tijd en geld lijken te kosten, is het altijd raadzaam om ze toch in te plannen. Als je deze afspraken niet maakt, neemt de kans op een groter probleem in het systeem drastisch toe. De reparatiekosten van zo'n probleem kunnen de uitgaven voor periodieke onderhoudsafspraken overstijgen.